Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Cnn2Q08093 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms