Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Gdf3Q07104 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gdf3Q07104 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms