Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms