Protein–RNA interactions for Protein: Q04888

Sox10, Transcription factor SOX-10, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox10Q04888 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox10Q04888 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sox10Q04888 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sox10Q04888 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sox10Q04888 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sox10Q04888 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sox10Q04888 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sox10Q04888 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sox10Q04888 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sox10Q04888 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sox10Q04888 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sox10Q04888 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sox10Q04888 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sox10Q04888 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox10Q04888 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox10Q04888 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox10Q04888 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox10Q04888 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox10Q04888 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox10Q04888 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox10Q04888 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox10Q04888 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox10Q04888 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox10Q04888 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox10Q04888 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox10Q04888 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox10Q04888 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox10Q04888 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox10Q04888 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox10Q04888 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox10Q04888 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox10Q04888 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox10Q04888 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox10Q04888 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox10Q04888 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox10Q04888 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox10Q04888 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox10Q04888 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox10Q04888 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox10Q04888 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox10Q04888 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox10Q04888 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox10Q04888 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox10Q04888 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox10Q04888 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox10Q04888 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox10Q04888 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox10Q04888 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox10Q04888 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sox10Q04888 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Sox10Q04888 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox10Q04888 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox10Q04888 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox10Q04888 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox10Q04888 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Sox10Q04888 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox10Q04888 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Sox10Q04888 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox10Q04888 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox10Q04888 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox10Q04888 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sox10Q04888 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sox10Q04888 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sox10Q04888 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sox10Q04888 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sox10Q04888 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Sox10Q04888 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Sox10Q04888 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox10Q04888 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox10Q04888 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox10Q04888 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Sox10Q04888 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox10Q04888 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sox10Q04888 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Sox10Q04888 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sox10Q04888 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox10Q04888 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox10Q04888 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox10Q04888 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox10Q04888 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox10Q04888 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox10Q04888 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox10Q04888 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox10Q04888 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox10Q04888 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox10Q04888 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox10Q04888 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox10Q04888 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox10Q04888 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox10Q04888 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox10Q04888 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox10Q04888 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms