Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarcad1Q04692 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms