Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Msx2Q03358 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.1 ms