Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GscQ02591 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GscQ02591 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GscQ02591 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GscQ02591 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GscQ02591 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GscQ02591 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GscQ02591 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GscQ02591 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GscQ02591 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GscQ02591 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GscQ02591 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GscQ02591 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GscQ02591 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GscQ02591 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GscQ02591 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GscQ02591 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GscQ02591 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GscQ02591 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GscQ02591 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GscQ02591 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GscQ02591 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GscQ02591 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GscQ02591 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GscQ02591 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GscQ02591 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GscQ02591 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GscQ02591 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GscQ02591 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GscQ02591 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GscQ02591 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GscQ02591 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GscQ02591 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GscQ02591 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GscQ02591 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GscQ02591 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GscQ02591 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GscQ02591 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GscQ02591 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GscQ02591 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GscQ02591 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GscQ02591 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GscQ02591 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GscQ02591 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GscQ02591 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GscQ02591 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GscQ02591 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GscQ02591 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GscQ02591 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GscQ02591 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GscQ02591 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
GscQ02591 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GscQ02591 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GscQ02591 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GscQ02591 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GscQ02591 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GscQ02591 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GscQ02591 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GscQ02591 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GscQ02591 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GscQ02591 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GscQ02591 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GscQ02591 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GscQ02591 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GscQ02591 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GscQ02591 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GscQ02591 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GscQ02591 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GscQ02591 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GscQ02591 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GscQ02591 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GscQ02591 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GscQ02591 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GscQ02591 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GscQ02591 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GscQ02591 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GscQ02591 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GscQ02591 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GscQ02591 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GscQ02591 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GscQ02591 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GscQ02591 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GscQ02591 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GscQ02591 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GscQ02591 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GscQ02591 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GscQ02591 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GscQ02591 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC15.07■□□□□ 0
GscQ02591 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GscQ02591 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GscQ02591 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GscQ02591 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GscQ02591 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GscQ02591 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GscQ02591 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GscQ02591 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GscQ02591 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GscQ02591 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GscQ02591 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GscQ02591 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms