Protein–RNA interactions for Protein: Q02525

Zfp39, Zinc finger protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp39Q02525 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zfp39Q02525 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zfp39Q02525 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zfp39Q02525 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfp39Q02525 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfp39Q02525 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfp39Q02525 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfp39Q02525 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfp39Q02525 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfp39Q02525 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfp39Q02525 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfp39Q02525 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfp39Q02525 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfp39Q02525 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfp39Q02525 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfp39Q02525 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfp39Q02525 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfp39Q02525 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfp39Q02525 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfp39Q02525 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfp39Q02525 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfp39Q02525 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfp39Q02525 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfp39Q02525 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfp39Q02525 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfp39Q02525 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfp39Q02525 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfp39Q02525 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfp39Q02525 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfp39Q02525 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfp39Q02525 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfp39Q02525 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfp39Q02525 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfp39Q02525 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfp39Q02525 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfp39Q02525 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfp39Q02525 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfp39Q02525 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfp39Q02525 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfp39Q02525 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfp39Q02525 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfp39Q02525 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfp39Q02525 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfp39Q02525 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfp39Q02525 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp39Q02525 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp39Q02525 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp39Q02525 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp39Q02525 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp39Q02525 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp39Q02525 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp39Q02525 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp39Q02525 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp39Q02525 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp39Q02525 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp39Q02525 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp39Q02525 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp39Q02525 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp39Q02525 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp39Q02525 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp39Q02525 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp39Q02525 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp39Q02525 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp39Q02525 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp39Q02525 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp39Q02525 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp39Q02525 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp39Q02525 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp39Q02525 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp39Q02525 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp39Q02525 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp39Q02525 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp39Q02525 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp39Q02525 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp39Q02525 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp39Q02525 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp39Q02525 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp39Q02525 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Zfp39Q02525 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zfp39Q02525 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zfp39Q02525 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zfp39Q02525 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zfp39Q02525 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zfp39Q02525 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zfp39Q02525 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zfp39Q02525 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zfp39Q02525 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zfp39Q02525 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zfp39Q02525 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zfp39Q02525 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zfp39Q02525 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zfp39Q02525 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zfp39Q02525 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zfp39Q02525 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Zfp39Q02525 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zfp39Q02525 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Zfp39Q02525 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zfp39Q02525 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Zfp39Q02525 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Zfp39Q02525 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms