Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms