Protein–RNA interactions for Protein: Q01768

Nme2, Nucleoside diphosphate kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme2Q01768 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nme2Q01768 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nme2Q01768 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nme2Q01768 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nme2Q01768 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Nme2Q01768 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nme2Q01768 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nme2Q01768 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nme2Q01768 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nme2Q01768 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nme2Q01768 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nme2Q01768 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nme2Q01768 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nme2Q01768 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nme2Q01768 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nme2Q01768 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nme2Q01768 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nme2Q01768 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nme2Q01768 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nme2Q01768 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nme2Q01768 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nme2Q01768 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nme2Q01768 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nme2Q01768 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nme2Q01768 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nme2Q01768 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nme2Q01768 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nme2Q01768 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nme2Q01768 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Nme2Q01768 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nme2Q01768 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nme2Q01768 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Nme2Q01768 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nme2Q01768 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Nme2Q01768 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nme2Q01768 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Nme2Q01768 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nme2Q01768 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Nme2Q01768 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Nme2Q01768 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Nme2Q01768 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nme2Q01768 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nme2Q01768 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nme2Q01768 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nme2Q01768 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nme2Q01768 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nme2Q01768 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nme2Q01768 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nme2Q01768 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nme2Q01768 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nme2Q01768 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nme2Q01768 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nme2Q01768 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nme2Q01768 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nme2Q01768 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nme2Q01768 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nme2Q01768 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nme2Q01768 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nme2Q01768 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nme2Q01768 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nme2Q01768 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nme2Q01768 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nme2Q01768 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nme2Q01768 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nme2Q01768 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nme2Q01768 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nme2Q01768 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nme2Q01768 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nme2Q01768 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nme2Q01768 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nme2Q01768 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nme2Q01768 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nme2Q01768 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nme2Q01768 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nme2Q01768 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nme2Q01768 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nme2Q01768 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nme2Q01768 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nme2Q01768 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nme2Q01768 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nme2Q01768 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nme2Q01768 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nme2Q01768 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nme2Q01768 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nme2Q01768 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nme2Q01768 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nme2Q01768 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nme2Q01768 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nme2Q01768 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nme2Q01768 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nme2Q01768 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nme2Q01768 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nme2Q01768 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nme2Q01768 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nme2Q01768 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Nme2Q01768 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nme2Q01768 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nme2Q01768 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nme2Q01768 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nme2Q01768 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms