Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gja5Q01231 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gja5Q01231 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gja5Q01231 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gja5Q01231 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gja5Q01231 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gja5Q01231 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gja5Q01231 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gja5Q01231 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gja5Q01231 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gja5Q01231 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gja5Q01231 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gja5Q01231 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gja5Q01231 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gja5Q01231 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gja5Q01231 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gja5Q01231 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gja5Q01231 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gja5Q01231 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gja5Q01231 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gja5Q01231 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gja5Q01231 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gja5Q01231 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gja5Q01231 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gja5Q01231 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gja5Q01231 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gja5Q01231 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gja5Q01231 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gja5Q01231 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gja5Q01231 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gja5Q01231 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gja5Q01231 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gja5Q01231 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gja5Q01231 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gja5Q01231 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gja5Q01231 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gja5Q01231 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gja5Q01231 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gja5Q01231 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gja5Q01231 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms