Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC10□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms