Protein–RNA interactions for Protein: P97769

Cited1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited1P97769 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cited1P97769 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cited1P97769 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cited1P97769 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cited1P97769 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cited1P97769 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cited1P97769 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cited1P97769 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms