Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms