Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Bop1P97452 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Bop1P97452 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Bop1P97452 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Bop1P97452 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Bop1P97452 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms