Protein–RNA interactions for Protein: P70354

Msx3, Homeobox protein MSX-3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx3P70354 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Msx3P70354 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Msx3P70354 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Msx3P70354 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Msx3P70354 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Msx3P70354 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Msx3P70354 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Msx3P70354 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Msx3P70354 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Msx3P70354 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Msx3P70354 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Msx3P70354 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Msx3P70354 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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