Protein–RNA interactions for Protein: P70338

Gfi1, Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

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Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1P70338 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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