Protein–RNA interactions for Protein: P70232

Chl1, Neural cell adhesion molecule L1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chl1P70232 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Chl1P70232 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Chl1P70232 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Chl1P70232 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Chl1P70232 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Chl1P70232 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Chl1P70232 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Chl1P70232 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Chl1P70232 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Chl1P70232 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Chl1P70232 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Chl1P70232 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Chl1P70232 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Chl1P70232 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Chl1P70232 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Chl1P70232 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Chl1P70232 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Chl1P70232 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Chl1P70232 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Chl1P70232 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Chl1P70232 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Chl1P70232 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Chl1P70232 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Chl1P70232 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Chl1P70232 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Chl1P70232 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Chl1P70232 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Chl1P70232 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Chl1P70232 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Chl1P70232 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Chl1P70232 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Chl1P70232 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Chl1P70232 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Chl1P70232 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Chl1P70232 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Chl1P70232 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Chl1P70232 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Chl1P70232 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Chl1P70232 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Chl1P70232 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Chl1P70232 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Chl1P70232 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Chl1P70232 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Chl1P70232 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Chl1P70232 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Chl1P70232 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Chl1P70232 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Chl1P70232 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Chl1P70232 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Chl1P70232 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Chl1P70232 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Chl1P70232 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Chl1P70232 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Chl1P70232 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Chl1P70232 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Chl1P70232 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Chl1P70232 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Chl1P70232 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Chl1P70232 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Chl1P70232 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Chl1P70232 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Chl1P70232 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Chl1P70232 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Chl1P70232 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Chl1P70232 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Chl1P70232 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Chl1P70232 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Chl1P70232 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Chl1P70232 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Chl1P70232 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Chl1P70232 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Chl1P70232 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Chl1P70232 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Chl1P70232 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Chl1P70232 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Chl1P70232 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Chl1P70232 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Chl1P70232 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Chl1P70232 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Chl1P70232 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Chl1P70232 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Chl1P70232 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Chl1P70232 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Chl1P70232 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Chl1P70232 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Chl1P70232 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Chl1P70232 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Chl1P70232 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Chl1P70232 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Chl1P70232 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Chl1P70232 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Chl1P70232 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Chl1P70232 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Chl1P70232 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Chl1P70232 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Chl1P70232 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Chl1P70232 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Chl1P70232 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Chl1P70232 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Chl1P70232 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms