Protein–RNA interactions for Protein: P68372

Tubb4b, Tubulin beta-4B chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4bP68372 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms