Protein–RNA interactions for Protein: P62746

Rhob, Rho-related GTP-binding protein RhoB, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhobP62746 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RhobP62746 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RhobP62746 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RhobP62746 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RhobP62746 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
RhobP62746 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
RhobP62746 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RhobP62746 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RhobP62746 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
RhobP62746 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RhobP62746 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
RhobP62746 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
RhobP62746 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RhobP62746 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RhobP62746 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RhobP62746 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RhobP62746 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RhobP62746 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RhobP62746 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RhobP62746 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RhobP62746 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RhobP62746 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RhobP62746 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RhobP62746 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RhobP62746 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RhobP62746 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RhobP62746 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RhobP62746 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RhobP62746 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RhobP62746 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RhobP62746 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
RhobP62746 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
RhobP62746 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.6
RhobP62746 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
RhobP62746 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
RhobP62746 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.6
RhobP62746 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
RhobP62746 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
RhobP62746 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
RhobP62746 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
RhobP62746 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
RhobP62746 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
RhobP62746 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
RhobP62746 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
RhobP62746 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
RhobP62746 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
RhobP62746 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RhobP62746 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RhobP62746 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
RhobP62746 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
RhobP62746 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
RhobP62746 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
RhobP62746 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
RhobP62746 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
RhobP62746 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RhobP62746 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RhobP62746 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RhobP62746 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RhobP62746 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
RhobP62746 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RhobP62746 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RhobP62746 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RhobP62746 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
RhobP62746 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RhobP62746 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RhobP62746 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
RhobP62746 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RhobP62746 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RhobP62746 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RhobP62746 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RhobP62746 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RhobP62746 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RhobP62746 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RhobP62746 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RhobP62746 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RhobP62746 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RhobP62746 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RhobP62746 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RhobP62746 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RhobP62746 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RhobP62746 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RhobP62746 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
RhobP62746 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RhobP62746 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
RhobP62746 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RhobP62746 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RhobP62746 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RhobP62746 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RhobP62746 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RhobP62746 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RhobP62746 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RhobP62746 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RhobP62746 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RhobP62746 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RhobP62746 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RhobP62746 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RhobP62746 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RhobP62746 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RhobP62746 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RhobP62746 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms