Protein–RNA interactions for Protein: P62307

Snrpf, Small nuclear ribonucleoprotein F, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpfP62307 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SnrpfP62307 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SnrpfP62307 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SnrpfP62307 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SnrpfP62307 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SnrpfP62307 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SnrpfP62307 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SnrpfP62307 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SnrpfP62307 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SnrpfP62307 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SnrpfP62307 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SnrpfP62307 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SnrpfP62307 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SnrpfP62307 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SnrpfP62307 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SnrpfP62307 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SnrpfP62307 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SnrpfP62307 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SnrpfP62307 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SnrpfP62307 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SnrpfP62307 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SnrpfP62307 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SnrpfP62307 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SnrpfP62307 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SnrpfP62307 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SnrpfP62307 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SnrpfP62307 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SnrpfP62307 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SnrpfP62307 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SnrpfP62307 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SnrpfP62307 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SnrpfP62307 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SnrpfP62307 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SnrpfP62307 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SnrpfP62307 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SnrpfP62307 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SnrpfP62307 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SnrpfP62307 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SnrpfP62307 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SnrpfP62307 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SnrpfP62307 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SnrpfP62307 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SnrpfP62307 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SnrpfP62307 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SnrpfP62307 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SnrpfP62307 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SnrpfP62307 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SnrpfP62307 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SnrpfP62307 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SnrpfP62307 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SnrpfP62307 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SnrpfP62307 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SnrpfP62307 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SnrpfP62307 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SnrpfP62307 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SnrpfP62307 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SnrpfP62307 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SnrpfP62307 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SnrpfP62307 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SnrpfP62307 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SnrpfP62307 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SnrpfP62307 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SnrpfP62307 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SnrpfP62307 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SnrpfP62307 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SnrpfP62307 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SnrpfP62307 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SnrpfP62307 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SnrpfP62307 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SnrpfP62307 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SnrpfP62307 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SnrpfP62307 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SnrpfP62307 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SnrpfP62307 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SnrpfP62307 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SnrpfP62307 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SnrpfP62307 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SnrpfP62307 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SnrpfP62307 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SnrpfP62307 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SnrpfP62307 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SnrpfP62307 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SnrpfP62307 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SnrpfP62307 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SnrpfP62307 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SnrpfP62307 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SnrpfP62307 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SnrpfP62307 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SnrpfP62307 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SnrpfP62307 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SnrpfP62307 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SnrpfP62307 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SnrpfP62307 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SnrpfP62307 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SnrpfP62307 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SnrpfP62307 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SnrpfP62307 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SnrpfP62307 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SnrpfP62307 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SnrpfP62307 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms