Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Lmo4P61969 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms