Protein–RNA interactions for Protein: P58873

Rhbdl3, Rhomboid-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl3P58873 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhbdl3P58873 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhbdl3P58873 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhbdl3P58873 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhbdl3P58873 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhbdl3P58873 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhbdl3P58873 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhbdl3P58873 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhbdl3P58873 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhbdl3P58873 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhbdl3P58873 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhbdl3P58873 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhbdl3P58873 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhbdl3P58873 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhbdl3P58873 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhbdl3P58873 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhbdl3P58873 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhbdl3P58873 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhbdl3P58873 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhbdl3P58873 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhbdl3P58873 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhbdl3P58873 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhbdl3P58873 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhbdl3P58873 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhbdl3P58873 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhbdl3P58873 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhbdl3P58873 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhbdl3P58873 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhbdl3P58873 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhbdl3P58873 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhbdl3P58873 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhbdl3P58873 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhbdl3P58873 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhbdl3P58873 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhbdl3P58873 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhbdl3P58873 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhbdl3P58873 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhbdl3P58873 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhbdl3P58873 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rhbdl3P58873 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rhbdl3P58873 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rhbdl3P58873 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rhbdl3P58873 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rhbdl3P58873 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rhbdl3P58873 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rhbdl3P58873 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rhbdl3P58873 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rhbdl3P58873 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rhbdl3P58873 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rhbdl3P58873 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rhbdl3P58873 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rhbdl3P58873 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rhbdl3P58873 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rhbdl3P58873 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rhbdl3P58873 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rhbdl3P58873 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rhbdl3P58873 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rhbdl3P58873 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rhbdl3P58873 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rhbdl3P58873 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rhbdl3P58873 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rhbdl3P58873 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rhbdl3P58873 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rhbdl3P58873 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rhbdl3P58873 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rhbdl3P58873 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rhbdl3P58873 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rhbdl3P58873 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rhbdl3P58873 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rhbdl3P58873 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rhbdl3P58873 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rhbdl3P58873 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rhbdl3P58873 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rhbdl3P58873 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rhbdl3P58873 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rhbdl3P58873 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rhbdl3P58873 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rhbdl3P58873 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rhbdl3P58873 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rhbdl3P58873 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rhbdl3P58873 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rhbdl3P58873 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rhbdl3P58873 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rhbdl3P58873 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rhbdl3P58873 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rhbdl3P58873 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rhbdl3P58873 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rhbdl3P58873 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rhbdl3P58873 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rhbdl3P58873 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rhbdl3P58873 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rhbdl3P58873 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rhbdl3P58873 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rhbdl3P58873 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rhbdl3P58873 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rhbdl3P58873 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rhbdl3P58873 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rhbdl3P58873 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rhbdl3P58873 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rhbdl3P58873 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms