Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
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Cldn18P56857 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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