Protein–RNA interactions for Protein: P56480

Atp5b, ATP synthase subunit beta, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5bP56480 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Atp5bP56480 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atp5bP56480 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atp5bP56480 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atp5bP56480 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atp5bP56480 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Atp5bP56480 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atp5bP56480 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atp5bP56480 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atp5bP56480 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atp5bP56480 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms