Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rrp1P56183 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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