Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NcanP55066 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NcanP55066 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NcanP55066 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
NcanP55066 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NcanP55066 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NcanP55066 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
NcanP55066 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
NcanP55066 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
NcanP55066 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NcanP55066 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NcanP55066 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NcanP55066 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NcanP55066 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NcanP55066 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NcanP55066 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NcanP55066 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NcanP55066 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NcanP55066 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NcanP55066 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NcanP55066 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NcanP55066 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NcanP55066 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NcanP55066 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NcanP55066 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NcanP55066 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NcanP55066 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NcanP55066 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NcanP55066 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NcanP55066 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NcanP55066 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NcanP55066 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NcanP55066 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NcanP55066 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NcanP55066 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
NcanP55066 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NcanP55066 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
NcanP55066 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NcanP55066 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NcanP55066 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
NcanP55066 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NcanP55066 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
NcanP55066 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
NcanP55066 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
NcanP55066 Tex30-201ENSMUST00000027215 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NcanP55066 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NcanP55066 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NcanP55066 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NcanP55066 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NcanP55066 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NcanP55066 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NcanP55066 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NcanP55066 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NcanP55066 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NcanP55066 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NcanP55066 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NcanP55066 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NcanP55066 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NcanP55066 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NcanP55066 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NcanP55066 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
NcanP55066 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
NcanP55066 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
NcanP55066 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
NcanP55066 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NcanP55066 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NcanP55066 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NcanP55066 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
NcanP55066 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NcanP55066 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
NcanP55066 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
NcanP55066 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NcanP55066 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NcanP55066 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
NcanP55066 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
NcanP55066 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NcanP55066 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NcanP55066 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NcanP55066 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NcanP55066 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
NcanP55066 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NcanP55066 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NcanP55066 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NcanP55066 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NcanP55066 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NcanP55066 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NcanP55066 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NcanP55066 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NcanP55066 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NcanP55066 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NcanP55066 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
NcanP55066 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NcanP55066 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NcanP55066 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NcanP55066 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NcanP55066 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NcanP55066 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NcanP55066 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NcanP55066 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NcanP55066 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms