Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms