Protein–RNA interactions for Protein: P50405

Sftpb, Pulmonary surfactant-associated protein B, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpbP50405 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SftpbP50405 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SftpbP50405 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SftpbP50405 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SftpbP50405 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SftpbP50405 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SftpbP50405 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SftpbP50405 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SftpbP50405 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SftpbP50405 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SftpbP50405 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SftpbP50405 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SftpbP50405 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SftpbP50405 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SftpbP50405 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SftpbP50405 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SftpbP50405 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SftpbP50405 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SftpbP50405 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SftpbP50405 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SftpbP50405 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SftpbP50405 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SftpbP50405 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SftpbP50405 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SftpbP50405 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SftpbP50405 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SftpbP50405 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SftpbP50405 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SftpbP50405 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SftpbP50405 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SftpbP50405 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SftpbP50405 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SftpbP50405 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SftpbP50405 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SftpbP50405 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SftpbP50405 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SftpbP50405 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SftpbP50405 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SftpbP50405 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SftpbP50405 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SftpbP50405 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SftpbP50405 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SftpbP50405 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SftpbP50405 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SftpbP50405 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SftpbP50405 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SftpbP50405 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SftpbP50405 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SftpbP50405 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SftpbP50405 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SftpbP50405 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SftpbP50405 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SftpbP50405 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SftpbP50405 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SftpbP50405 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SftpbP50405 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SftpbP50405 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SftpbP50405 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SftpbP50405 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SftpbP50405 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SftpbP50405 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SftpbP50405 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SftpbP50405 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SftpbP50405 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SftpbP50405 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SftpbP50405 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SftpbP50405 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SftpbP50405 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SftpbP50405 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SftpbP50405 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SftpbP50405 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SftpbP50405 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SftpbP50405 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SftpbP50405 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SftpbP50405 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SftpbP50405 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SftpbP50405 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SftpbP50405 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SftpbP50405 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SftpbP50405 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SftpbP50405 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SftpbP50405 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SftpbP50405 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SftpbP50405 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SftpbP50405 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SftpbP50405 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SftpbP50405 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SftpbP50405 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SftpbP50405 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SftpbP50405 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SftpbP50405 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SftpbP50405 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SftpbP50405 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SftpbP50405 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SftpbP50405 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SftpbP50405 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SftpbP50405 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SftpbP50405 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SftpbP50405 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SftpbP50405 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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