Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SftpdP50404 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SftpdP50404 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SftpdP50404 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SftpdP50404 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SftpdP50404 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SftpdP50404 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SftpdP50404 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SftpdP50404 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms