Protein–RNA interactions for Protein: P50136

Bckdha, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit alpha, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdhaP50136 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
BckdhaP50136 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
BckdhaP50136 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
BckdhaP50136 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
BckdhaP50136 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
BckdhaP50136 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
BckdhaP50136 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
BckdhaP50136 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
BckdhaP50136 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
BckdhaP50136 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
BckdhaP50136 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BckdhaP50136 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
BckdhaP50136 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BckdhaP50136 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BckdhaP50136 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
BckdhaP50136 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BckdhaP50136 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BckdhaP50136 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BckdhaP50136 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BckdhaP50136 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
BckdhaP50136 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BckdhaP50136 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
BckdhaP50136 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BckdhaP50136 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BckdhaP50136 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BckdhaP50136 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
BckdhaP50136 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
BckdhaP50136 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BckdhaP50136 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
BckdhaP50136 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
BckdhaP50136 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
BckdhaP50136 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
BckdhaP50136 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
BckdhaP50136 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
BckdhaP50136 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
BckdhaP50136 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
BckdhaP50136 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
BckdhaP50136 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BckdhaP50136 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BckdhaP50136 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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