Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PtpreP49446 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtpreP49446 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtpreP49446 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtpreP49446 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtpreP49446 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms