Protein–RNA interactions for Protein: P48754

Brca1, Breast cancer type 1 susceptibility protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brca1P48754 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brca1P48754 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brca1P48754 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brca1P48754 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brca1P48754 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brca1P48754 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brca1P48754 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Brca1P48754 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brca1P48754 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Brca1P48754 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brca1P48754 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brca1P48754 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brca1P48754 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brca1P48754 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brca1P48754 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brca1P48754 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brca1P48754 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Brca1P48754 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brca1P48754 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brca1P48754 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brca1P48754 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brca1P48754 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brca1P48754 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brca1P48754 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brca1P48754 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brca1P48754 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brca1P48754 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Brca1P48754 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brca1P48754 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Brca1P48754 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Brca1P48754 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Brca1P48754 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brca1P48754 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brca1P48754 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brca1P48754 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Brca1P48754 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brca1P48754 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Brca1P48754 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brca1P48754 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brca1P48754 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brca1P48754 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brca1P48754 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brca1P48754 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brca1P48754 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brca1P48754 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brca1P48754 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brca1P48754 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brca1P48754 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Brca1P48754 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Brca1P48754 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brca1P48754 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brca1P48754 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brca1P48754 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brca1P48754 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brca1P48754 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brca1P48754 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brca1P48754 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brca1P48754 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Brca1P48754 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brca1P48754 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brca1P48754 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brca1P48754 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brca1P48754 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Brca1P48754 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brca1P48754 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brca1P48754 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brca1P48754 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brca1P48754 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brca1P48754 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brca1P48754 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brca1P48754 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brca1P48754 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Brca1P48754 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brca1P48754 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brca1P48754 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brca1P48754 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brca1P48754 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brca1P48754 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brca1P48754 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brca1P48754 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brca1P48754 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brca1P48754 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brca1P48754 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brca1P48754 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brca1P48754 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brca1P48754 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Brca1P48754 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Brca1P48754 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Brca1P48754 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Brca1P48754 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brca1P48754 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brca1P48754 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brca1P48754 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brca1P48754 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brca1P48754 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Brca1P48754 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Brca1P48754 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Brca1P48754 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brca1P48754 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Brca1P48754 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms