Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms