Protein–RNA interactions for Protein: P48193

Epb41, Protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41P48193 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Epb41P48193 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Epb41P48193 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Epb41P48193 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Epb41P48193 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Epb41P48193 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Epb41P48193 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Epb41P48193 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Epb41P48193 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Epb41P48193 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Epb41P48193 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Epb41P48193 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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