Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SrprbP47758 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SrprbP47758 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms