Protein–RNA interactions for Protein: P43407

Sdc2, Syndecan-2, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc2P43407 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms