Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms