Protein–RNA interactions for Protein: P41969

Elk1, ETS domain-containing protein Elk-1, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elk1P41969 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Elk1P41969 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Elk1P41969 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Elk1P41969 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Elk1P41969 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Elk1P41969 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Elk1P41969 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Elk1P41969 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Elk1P41969 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Elk1P41969 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Elk1P41969 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Elk1P41969 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Elk1P41969 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Elk1P41969 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Elk1P41969 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Elk1P41969 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Elk1P41969 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Elk1P41969 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Elk1P41969 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Elk1P41969 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Elk1P41969 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Elk1P41969 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Elk1P41969 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Elk1P41969 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Elk1P41969 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Elk1P41969 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Elk1P41969 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Elk1P41969 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Elk1P41969 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Elk1P41969 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Elk1P41969 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Elk1P41969 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Elk1P41969 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Elk1P41969 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Elk1P41969 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Elk1P41969 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Elk1P41969 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Elk1P41969 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Elk1P41969 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Elk1P41969 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Elk1P41969 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Elk1P41969 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Elk1P41969 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Elk1P41969 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Elk1P41969 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Elk1P41969 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Elk1P41969 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Elk1P41969 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Elk1P41969 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Elk1P41969 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Elk1P41969 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Elk1P41969 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Elk1P41969 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Elk1P41969 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Elk1P41969 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Elk1P41969 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Elk1P41969 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Elk1P41969 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Elk1P41969 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Elk1P41969 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Elk1P41969 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Elk1P41969 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Elk1P41969 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Elk1P41969 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Elk1P41969 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Elk1P41969 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Elk1P41969 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Elk1P41969 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Elk1P41969 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Elk1P41969 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Elk1P41969 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Elk1P41969 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Elk1P41969 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Elk1P41969 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Elk1P41969 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Elk1P41969 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Elk1P41969 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Elk1P41969 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Elk1P41969 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Elk1P41969 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Elk1P41969 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Elk1P41969 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Elk1P41969 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Elk1P41969 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Elk1P41969 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Elk1P41969 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Elk1P41969 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Elk1P41969 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Elk1P41969 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Elk1P41969 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Elk1P41969 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Elk1P41969 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Elk1P41969 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Elk1P41969 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Elk1P41969 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Elk1P41969 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Elk1P41969 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Elk1P41969 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Elk1P41969 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Elk1P41969 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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