Protein–RNA interactions for Protein: P35710

Sox5, Transcription factor SOX-5, mousemouse

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox5P35710 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox5P35710 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox5P35710 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox5P35710 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox5P35710 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox5P35710 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox5P35710 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox5P35710 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox5P35710 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox5P35710 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox5P35710 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox5P35710 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox5P35710 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox5P35710 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox5P35710 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox5P35710 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox5P35710 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox5P35710 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox5P35710 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox5P35710 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox5P35710 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox5P35710 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox5P35710 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox5P35710 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox5P35710 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox5P35710 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox5P35710 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox5P35710 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox5P35710 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox5P35710 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox5P35710 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox5P35710 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox5P35710 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox5P35710 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox5P35710 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox5P35710 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox5P35710 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox5P35710 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox5P35710 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox5P35710 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox5P35710 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox5P35710 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox5P35710 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox5P35710 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox5P35710 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox5P35710 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox5P35710 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox5P35710 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox5P35710 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox5P35710 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox5P35710 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox5P35710 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox5P35710 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox5P35710 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox5P35710 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox5P35710 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox5P35710 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox5P35710 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox5P35710 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox5P35710 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox5P35710 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox5P35710 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox5P35710 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox5P35710 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox5P35710 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox5P35710 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox5P35710 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox5P35710 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox5P35710 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox5P35710 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox5P35710 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox5P35710 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox5P35710 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox5P35710 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox5P35710 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox5P35710 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox5P35710 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox5P35710 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox5P35710 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox5P35710 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox5P35710 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox5P35710 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox5P35710 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox5P35710 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox5P35710 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox5P35710 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox5P35710 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox5P35710 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox5P35710 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox5P35710 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox5P35710 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox5P35710 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox5P35710 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox5P35710 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox5P35710 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox5P35710 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox5P35710 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox5P35710 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox5P35710 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox5P35710 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms