Protein–RNA interactions for Protein: P35438

Grin1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin1P35438 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grin1P35438 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grin1P35438 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grin1P35438 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grin1P35438 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms