Protein–RNA interactions for Protein: P35235

Ptpn11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn11P35235 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms