Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

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Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp4P35123 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp4P35123 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp4P35123 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp4P35123 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp4P35123 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp4P35123 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp4P35123 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp4P35123 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp4P35123 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp4P35123 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp4P35123 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp4P35123 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp4P35123 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp4P35123 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp4P35123 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp4P35123 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp4P35123 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp4P35123 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp4P35123 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp4P35123 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp4P35123 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp4P35123 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp4P35123 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp4P35123 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp4P35123 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp4P35123 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp4P35123 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp4P35123 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp4P35123 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp4P35123 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp4P35123 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp4P35123 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp4P35123 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp4P35123 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp4P35123 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp4P35123 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp4P35123 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp4P35123 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp4P35123 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp4P35123 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp4P35123 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp4P35123 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp4P35123 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp4P35123 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp4P35123 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp4P35123 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp4P35123 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp4P35123 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp4P35123 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp4P35123 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp4P35123 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp4P35123 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp4P35123 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp4P35123 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp4P35123 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp4P35123 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp4P35123 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp4P35123 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp4P35123 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp4P35123 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp4P35123 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Usp4P35123 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Usp4P35123 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Usp4P35123 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Usp4P35123 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Usp4P35123 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Usp4P35123 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp4P35123 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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