Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Apoc1P34928 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Apoc1P34928 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Apoc1P34928 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Apoc1P34928 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Apoc1P34928 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Apoc1P34928 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Apoc1P34928 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Apoc1P34928 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Apoc1P34928 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Apoc1P34928 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Apoc1P34928 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Apoc1P34928 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Apoc1P34928 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Apoc1P34928 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Apoc1P34928 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Apoc1P34928 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Apoc1P34928 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Apoc1P34928 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Apoc1P34928 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Apoc1P34928 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Apoc1P34928 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Apoc1P34928 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Apoc1P34928 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Apoc1P34928 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Apoc1P34928 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Apoc1P34928 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Apoc1P34928 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Apoc1P34928 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Apoc1P34928 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Apoc1P34928 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Apoc1P34928 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Apoc1P34928 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Apoc1P34928 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Apoc1P34928 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Apoc1P34928 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Apoc1P34928 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Apoc1P34928 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Apoc1P34928 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Apoc1P34928 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Apoc1P34928 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Apoc1P34928 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Apoc1P34928 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Apoc1P34928 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Apoc1P34928 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Apoc1P34928 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Apoc1P34928 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Apoc1P34928 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Apoc1P34928 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Apoc1P34928 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Apoc1P34928 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Apoc1P34928 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Apoc1P34928 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Apoc1P34928 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Apoc1P34928 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Apoc1P34928 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Apoc1P34928 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Apoc1P34928 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Apoc1P34928 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Apoc1P34928 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Apoc1P34928 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Apoc1P34928 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Apoc1P34928 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Apoc1P34928 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Apoc1P34928 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Apoc1P34928 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Apoc1P34928 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Apoc1P34928 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Apoc1P34928 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Apoc1P34928 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Apoc1P34928 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Apoc1P34928 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Apoc1P34928 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Apoc1P34928 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Apoc1P34928 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Apoc1P34928 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Apoc1P34928 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Apoc1P34928 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Apoc1P34928 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Apoc1P34928 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Apoc1P34928 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Apoc1P34928 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Apoc1P34928 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Apoc1P34928 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Apoc1P34928 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Apoc1P34928 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Apoc1P34928 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Apoc1P34928 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Apoc1P34928 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Apoc1P34928 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Apoc1P34928 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Apoc1P34928 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Apoc1P34928 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Apoc1P34928 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Apoc1P34928 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Apoc1P34928 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Apoc1P34928 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Apoc1P34928 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Apoc1P34928 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Apoc1P34928 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms