Protein–RNA interactions for Protein: P28312

Defa5, Alpha-defensin 5, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa5P28312 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa5P28312 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa5P28312 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa5P28312 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa5P28312 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa5P28312 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa5P28312 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa5P28312 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa5P28312 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa5P28312 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms