Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ChgaP26339 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ChgaP26339 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ChgaP26339 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ChgaP26339 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ChgaP26339 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ChgaP26339 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ChgaP26339 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ChgaP26339 2900076G11Rik-201ENSMUST00000202297 631 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Gemin6-201ENSMUST00000069486 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ChgaP26339 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ChgaP26339 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ChgaP26339 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ChgaP26339 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ChgaP26339 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ChgaP26339 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ChgaP26339 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ChgaP26339 Clec4d-201ENSMUST00000032240 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ChgaP26339 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ChgaP26339 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ChgaP26339 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ChgaP26339 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ChgaP26339 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ChgaP26339 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ChgaP26339 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ChgaP26339 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ChgaP26339 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ChgaP26339 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ChgaP26339 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ChgaP26339 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ChgaP26339 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ChgaP26339 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ChgaP26339 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ChgaP26339 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ChgaP26339 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ChgaP26339 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ChgaP26339 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ChgaP26339 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ChgaP26339 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ChgaP26339 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ChgaP26339 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ChgaP26339 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ChgaP26339 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ChgaP26339 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ChgaP26339 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ChgaP26339 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ChgaP26339 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ChgaP26339 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ChgaP26339 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ChgaP26339 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ChgaP26339 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ChgaP26339 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ChgaP26339 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ChgaP26339 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms