Protein–RNA interactions for Protein: P23440

Pde6b, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6bP23440 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pde6bP23440 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pde6bP23440 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pde6bP23440 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pde6bP23440 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pde6bP23440 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pde6bP23440 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde6bP23440 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde6bP23440 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde6bP23440 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde6bP23440 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde6bP23440 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde6bP23440 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde6bP23440 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde6bP23440 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde6bP23440 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde6bP23440 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde6bP23440 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde6bP23440 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde6bP23440 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde6bP23440 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde6bP23440 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde6bP23440 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde6bP23440 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde6bP23440 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde6bP23440 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde6bP23440 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde6bP23440 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde6bP23440 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde6bP23440 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde6bP23440 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde6bP23440 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde6bP23440 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde6bP23440 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde6bP23440 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde6bP23440 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde6bP23440 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde6bP23440 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde6bP23440 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms