Protein–RNA interactions for Protein: P20615

Hoxb9, Homeobox protein Hox-B9, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb9P20615 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
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