Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms