Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NelfeP19426 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NelfeP19426 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NelfeP19426 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NelfeP19426 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NelfeP19426 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NelfeP19426 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NelfeP19426 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NelfeP19426 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NelfeP19426 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NelfeP19426 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NelfeP19426 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NelfeP19426 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NelfeP19426 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NelfeP19426 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
NelfeP19426 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NelfeP19426 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NelfeP19426 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NelfeP19426 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NelfeP19426 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NelfeP19426 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NelfeP19426 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NelfeP19426 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NelfeP19426 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
NelfeP19426 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NelfeP19426 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
NelfeP19426 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NelfeP19426 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NelfeP19426 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NelfeP19426 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NelfeP19426 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NelfeP19426 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NelfeP19426 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NelfeP19426 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NelfeP19426 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NelfeP19426 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NelfeP19426 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NelfeP19426 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NelfeP19426 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NelfeP19426 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NelfeP19426 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NelfeP19426 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NelfeP19426 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
NelfeP19426 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NelfeP19426 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
NelfeP19426 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NelfeP19426 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NelfeP19426 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NelfeP19426 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NelfeP19426 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NelfeP19426 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NelfeP19426 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NelfeP19426 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NelfeP19426 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NelfeP19426 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NelfeP19426 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NelfeP19426 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NelfeP19426 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NelfeP19426 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NelfeP19426 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NelfeP19426 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NelfeP19426 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NelfeP19426 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NelfeP19426 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NelfeP19426 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NelfeP19426 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NelfeP19426 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NelfeP19426 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NelfeP19426 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NelfeP19426 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NelfeP19426 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NelfeP19426 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NelfeP19426 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NelfeP19426 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NelfeP19426 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NelfeP19426 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NelfeP19426 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
NelfeP19426 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
NelfeP19426 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
NelfeP19426 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NelfeP19426 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NelfeP19426 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NelfeP19426 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NelfeP19426 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NelfeP19426 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
NelfeP19426 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
NelfeP19426 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
NelfeP19426 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NelfeP19426 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NelfeP19426 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
NelfeP19426 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NelfeP19426 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NelfeP19426 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NelfeP19426 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NelfeP19426 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NelfeP19426 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NelfeP19426 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NelfeP19426 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NelfeP19426 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
NelfeP19426 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms